Home

Procesamiento de biosecuencias mediante técnicas de Inferencia Gramatical

Speaker: José M. Sempere, Ph.D. (Polytechnic University of Valencia)

SEMINAR III

Abstract (spanish): En esta charla expondremos en primer lugar algunos fundamentos de la Inferencia Gramatical como técnicas de aprendizaje de lenguajes formales. A continuación abordaremos algunos problemas en relación con el procesamiento de biosecuencias (estructuras primarias en proteínas y secuencias de nucleótidos del ADN). Nos centraremos en dos aspectos: predicción de motivos funcionales en proteínas (motivo "coiled-coil" y "transmembrana") y alineamiento de secuencias de ADN. Para ello, veremos cómo la información en BD bioquímicas puede procesarse mediante algunos modelos de la teoría de lenguajes: autómatas finitos, lenguajes lineales pares y lenguajes lineales (mediante Autómatas de Watson-Crick) y cómo éstos se pueden aprender automáticamente mediante las técnicas de Inferencia Gramatical.

Information:

  • Date: Thursday, 16-06-2011.
  • Time: 13:00.
  • Place: Seminar room of the department H1.50 (Module H, First floor, E.T.S. Ingeniería Informática)
  • Language: Spanish

Funded by Red Temática en Computación Biomolecular y Biocelular (TIN2008-04487-E) (Ministerio de Ciencia e Innovación, fondos FEDER).